Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PGAM5Q96HS1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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