Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms