Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD6Q92537 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms