Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms