Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms