Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms