Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PPP4R4Q6NUP7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms