Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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