Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM259Q4ZIN3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms