Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GREB1Q4ZG55 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms