Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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