Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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