Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms