Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPTX1Q15818 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms