Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP4Q15650 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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