Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms