Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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PUM3Q15397 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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