Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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UBE3CQ15386 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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UBE3CQ15386 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3CQ15386 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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