Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms