Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
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SHROOM2Q13796 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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SHROOM2Q13796 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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SHROOM2Q13796 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
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SHROOM2Q13796 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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SHROOM2Q13796 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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SHROOM2Q13796 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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SHROOM2Q13796 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHROOM2Q13796 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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