Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms