Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNW1Q13573 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNW1Q13573 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms