Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAMK2BQ13554 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms