Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM28Q13263 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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