Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXF2Q12947 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXF2Q12947 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXF2Q12947 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXF2Q12947 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXF2Q12947 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXF2Q12947 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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