Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms