Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms