Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms