Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms