Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDC42EP1Q00587 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms