Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TUBA4AP68366 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TUBA4AP68366 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TUBA4AP68366 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TUBA4AP68366 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TUBA4AP68366 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TUBA4AP68366 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TUBA4AP68366 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TUBA4AP68366 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TUBA4AP68366 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TUBA4AP68366 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TUBA4AP68366 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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