Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms