Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NESP48681 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NESP48681 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NESP48681 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NESP48681 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NESP48681 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NESP48681 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NESP48681 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NESP48681 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NESP48681 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms