Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms