Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPOP42166 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms