Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX11P35716 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms