Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms