Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2AP24928 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms