Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI3P10071 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GLI3P10071 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GLI3P10071 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GLI3P10071 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GLI3P10071 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GLI3P10071 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GLI3P10071 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GLI3P10071 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI3P10071 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI3P10071 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI3P10071 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI3P10071 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI3P10071 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI3P10071 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI3P10071 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI3P10071 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GLI3P10071 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms