Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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