Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRRT4C9JH25 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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