Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNF879B4DU55 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNF879B4DU55 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF879B4DU55 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNF879B4DU55 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNF879B4DU55 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNF879B4DU55 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNF879B4DU55 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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ZNF879B4DU55 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ZNF879B4DU55 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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