Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms