Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms