Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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