Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM9Q9P0T7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM9Q9P0T7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms