Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms