Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms