Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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