Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms